Посетители музея могут увидеть историю региона, увековеченную в старых документах, рыболовные снасти, охотничье снаряжение, трофеи, церковную литературу, одежду, а также художественные произведения, созданные художником М. Шилейкисом, скульптуры сакрального искусства, старинные ткани и покрывала, типичные для этого региона. В музее постоянно действуют различные известные выставки, организовываются разные культурные мероприятия, государственные праздники. Музей и общественная библиотек работает в прогимназии, в здании красивой архитектуры, построенном в 1930-х годах.

В 1934 году в помещении Зарасайской прогимназии усилиями учителя С. Яунишкиса основан музей, который в конце декабря 1935 года переняли власти Зарасайского округа. В 1940 году в фондах музея было более 2000 экспонатов. В первые годы советской власти уничтожена большая часть экспонатов. Из бывших фондов музея остался только одни шкаф с несколькими экспонатами. В 1963 году музей был закрыт, и все экспонаты переданы краеведческому музею Рокишкиса. Весной 1967 года в Зарасай было открыто структурное подразделение краеведческого музея Рокишкиса. В 1969 году он основан в теперешнем построенном в 1931 году историческом здании, тогда предназначенном для Высшей коммерческой школы. 22 августа 1969 г. музей назван мемориальным музеем героини Советского Союза Марите Мельникайте. В конце 1987 года зарасайский музей стал самостоятельным, а в время Возрождения был назван Зарасайским краевым музеем.